上記規程がありますが、十分な知識と経験と体力を持つ方が自己責任において閉山中の富士山に挑んでいるのも事実であり、それによる遭難事故も発生しています。
こうした遭難事故の防止や自然環境を保全するため、平成25年に「富士登山における安全確保のためのガイドライン」（主に夏山期間以外における注意事項）が制定されています。
富士山においては、万全な準備をしない登山者の夏山期間以外の登山禁止をはじめとしたルールが決められていますので、これらのルールを遵守する様にお願いします。主な内容は以下のとおりです。

• 万全な準備をしない登山者の夏山期間以外の登山「禁止」
• 夏山期間以外については、「登山計画書」を必ず作成・提出すること
• 山中のトイレが使用できない夏山期間以外において、万全な準備をした登山者が登山を行う場合、携帯トイレを持参して、自らの排泄物を回収し、持ち帰ること